AtelieR 2024 : mini-bootcamp à Palaiseau
Où ? Quand ?
L’atelieR 2024 ou mini-bootcamp R du groupe State Of The R est prévu sur le Campus AgroParisSaclay dans les locaux de l’unité MIA-PS du 11 au 13 mars 2024.
StateoftheR est un réseau du département MathNum INRAE.
Il s’agisse de la première édition sous ce format, un thème privilégié sur 2-3 jours. Cet atelier réunit un groupe de chercheurs, ingénieurs, doctorants, tous utilisateurs avancés de R et développeurs de paquets pour explorer les dernières fonctionnalités du logiciel et les nouvelles pratiques de développement. A l’issue de l’atelier le collectif produit une synthèse de cette veille logiciel de manière à progresser collectivement dans l’utilisation du logiciel mais surtout dans la production d’outils statistiques à destination de la communauté.
Le résultat de cette semaine est disponible sur cette page
Thématique : analyse de données d’abondance multivariées
Exploration (liste initialement proposée) des modèles et outils :
gllvm : Generalized Linear Latent Variable Models
package R {gllvm} Estimation is performed using either Laplace approximation method or variational approximation method implemented via TMB (Kristensen et al., (2016). For details see Niku et al. (2019a) and Niku et al. (2019b).
hmsc : Hierarchical Modelling of Species Communities (HMSC) is a model-based approach for analyzing community ecological data (Ovaskainen et a.2017a).
PLNmodels
package R {PLNmodels} et Python {pyPLNmodels} site web : https://pln-team.github.io/PLNmodels/ Articles de référence
Participants
Julie Aubert, Christelle Hennequet-Antier, Mahendra Mariadassou, Laure Sansonnet, Pierre Barbillon, Barbara Bricout, Jeanne Tous, Emily Walker, Isabelle Sanchez, Marine Marjou, Tristan Mary-Huard, Eric Parent, Annaïg De Walsche, Bastien Batardière.
Soutien
