State of The R

Groupe de chercheurs et d’ingénieurs se réunissant pour approfondir leur savoir-faire, perfectionner la diffusion de leurs méthodes statistiques et échanger autour des dernières innovations de R et Rstudio. en savoir plus

groupe github slack

Organisation

Fonctionnement des ateliers participatifs

Le groupe se réunit à AgroParisTech au cours d’ateliers mensuels de 3 heures autour d’un thème prédéfini. Chaque atelier est animé par quelques membres (généralement deux ou trois) qui se chargent de présenter les enjeux du thème, fournir le bagage méthodologique nécessaire, et proposer des travaux pratiques.

Nous pensons qu’il est important que l’ensemble des participants s’investissent dans l’animation pour préserver l’esprit des ateliers. Les places sont donc limitées à une trentaine par séance.

Voir les ateliers passés

Devenir membre

Pour participer à ces ateliers, un aspirant membre peut assister à une séance pour jauger la teneur des séances et évaluer le niveau des participants. Il s’engage ensuite à animer une séance en proposant un atelier.

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Animation

La gestion du groupe (site web, liste de diffusion, bootcamp, recherche de financement, organisation des séances) est assurée par Julie Aubert, Julien Chiquet et Marie-Pierre Étienne. Vous pouvez nous contacter à l’adresse stateofr@gmail.com.

Ateliers à venir

La plupart des ateliers ont lieu dans la salle ACTIA à AgroParisTech.

Nous profiterons de la dernière séance de l’année pour faire un retour sur useR!2019, préparer le bootcamp de Roscoff ainsi que les ateliers de ‘année à venir. Chacun sera invité à intervenir!

Ateliers passés

More Posts

Au cours d’une séance découverte un peu spécial, donnée lors de l’assemblée générale du département de mathématique et informatique de l’INRA, Mahendra nous a fait découvrir les potentialités de {plotly,ggplotly,crosscall}

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Matthieu et Éric nous propose une séance sur {rSTAN}, l’interface R à la bibliothèque C++ Stan. Il s’agit d’algorithme inférence b yésienne utilisant une variante du Monte-Carlo Hamiltonien. On peut aussi faire de l’inférence fréquentiste par optimisation.

Gros travail de Éric et Matthieu, et une base de document introductif très fouillé, merci!

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Dans la continuité de ce qui a été fait à Beg-meil](https://stateofther.github.io/finistR2018/atelier3_package_creation.html), je vous propose un tour d’horizon des bonnes pratiques et de l’ensemble des outils disponibles pour réaliser le développement d’un package R. On parlera github, travis, {pkgdown], roxygen2, déploiement, {testthat], appveor, configure, Makevars, {usethis}, {devtools}, yaml, etc. Venez avec en tête de mettre les main dans le cambouis pour votre propre package.

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Séance dédiée à la préparation des satRday du lendemain:

Avec tous les bénévoles du groupe !

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R package {bigstatsr} provides a special class of matrix whose data is stored on the disk instead of the RAM, but you can still access the data almost as if it were in memory. It is particularly useful is you have a large matrix to analyze but not enough RAM on your computer. It can still be useful for matrices that fit in your RAM because package {bigstatsr} provides very efficient and parallelized algorithms (have you ever found cor or svd too slow?

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Marco et Vincent vous proposent de prendre un peu de temps pour apprendre à se servir du package exams (disponible sur le CRAN) pour générer automatiquement des examens (QCM ou autres), corriger automatiquement ces examens, gérer un ensemble d’exercices collectivement, mettre en place une plateforme de e-learning. Gros programme mais un joli cadeau de Noël, puisque tout se fait en quelques lignes de code R !

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Antoine, notre fanatique du tidyverse, nous propose de jeter un coup d’oeil à broom et rsample, des packages de tidymodels, pour travailler proprement (aka en format tibble) avec les sorties S3 des méthodes statistiques comme lm ou kmeans et faciliter l’utilisation des méthodes de rééchantillonage.

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Un duo de choc, Raphaëlle et Marie, pour une séance dense sur laquelle était posée l’ombre du data imaginist – et vive Harry Potter.

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Les trois mousquetaires Timothée, Mathieu et Félix (a.k.a riri fifi loulou) proposent une séances complète d’introduction à Rcpp accompagné de travaux pratiques.

Les documents de la séances:

Pour compléter, voir la page du bootcamp finistR2018 dédiée aux modules Rcpp.

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Bootcamp

Dans le même esprit que les ateliers mensuels, les bootcamp Finist’R © sont des ateliers d’une semaine que nous avons organisés en 2017 et 2018 à Roscoff et à Beg-Meil.

FinistR'19

Page web résumant les activités de la semaine d’ateliers à Roscoff 2019

FinistR'18

Page web résumant les activités de la semaine d’ateliers à Beg Meil 2018

FinistR'17

Mini poly bookdown résumant les activités de la semaine d’ateliers à Roscoff 2017